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Researcher DataBase - Personal Information :
Horiike Tokumasa
Horiike Tokumasa
Associate Professor
College of Global Interdisciplinary Science and Innovation
Faculty of Global Interdisciplinary Science and Innovation
Graduate School of Integrated Science and Technology Department of Agriculture - Biological and Environmental Sciences Course
Faculty of Agriculture - Department of Bioresource Sciences
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Last updated : 2024/04/25 2:05:08
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Basic information on teaching staff
| Gunma University 2002/12 |
Life Science - Evolutionary biology
Life Science - Genome biology |
| Massive data analysis, Bioinformatics, phylogenetic tree |
・Society of Evolutionary Studies, Japan
・Information Processing Society of Japan
・Society of Genome Microbiology, Japan |
Research information
[1].
61/6 257-259 (2023) [Refereed] refereed [Internationally co-authored papers] non-internationally co-authored paper
[Lead author or co-author] author
[Author] 堀池徳祐、渡邊知輝
[2]. OrthoPhy: A program to construct ortholog datasets using taxonomic information
Genome Biology and Evolution 15/3 1-16 (2023) [Refereed] refereed [Internationally co-authored papers] non-internationally co-authored paper
[Lead author or co-author] author
[Author] Tomoaki Watanabe, Akinori Kure, Tokumasa Horiike [DOI]
[3]. The Evolution of Molybdenum Dependent Nitrogenase in Cyanobacteria.
Biology 10/4 329- (2021) [Refereed] refereed [Internationally co-authored papers] non-internationally co-authored paper
[Lead author or co-author] author
[Author] Watanabe Tomoaki, Horiike Tokumasa [DOI]
[4].
2020/2 139-150 (2020) [Refereed] refereed [Internationally co-authored papers] non-internationally co-authored paper
[Lead author or co-author] co-author
[Author] 伊藤玄,古屋康則,堀池徳祐,向井貴彦
[5].
67/1 41-50 (2020) [Refereed] refereed [Internationally co-authored papers] non-internationally co-authored paper
[Lead author or co-author] co-author
[Author] 伊藤 玄, 古屋 康則, 堀池 徳祐, 向井 貴彦 [DOI]
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[1]. CELLULAR ORIGIN AND LIFE IN EXTREME HABITATS (Volume 3: Symbiosis, Nucleus Symbiosis Hypothesis Formation of Eukaryotic Cell Nuclei by the Symbiosis of Archaea in Bacteria)
Springer （2004）
[Book type]book(research)
[Sole author, co-author, or author and editor] joint work
[Author]篠澤 隆雄,堀池 徳祐,濱田 一男
[2].
（1999）
[Book type]book(research)
[Sole author, co-author, or author and editor] joint work
[Author]篠澤 隆雄,堀池 徳祐,,濱田 一男
[Notes] 第三章「生体システムの振る舞い」の一部で多細胞共生説について紹介した。
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[1]. NGSロングリードから遺伝子配列を 自動フェージングするソフトウエア
第24回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2024/3/3） other
[Presenter]桐生適誠、藤井浩、堀池徳祐
[2]. 長枝誘引が発生する瞬間に何が起こるか？
第24回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2024/3/3） other
[Presenter]仲田昇平、堀池徳祐
[3]. マルチプルアラインメントデータを用いて長枝誘引の本質を探る
日本進化学会第25回大会 （2023/8/31） other
[Presenter]仲田昇平、堀池徳祐
[4]. Farris系統樹を用いて長枝誘引の本質を探る
日本進化学会第25回大会 （2023/8/31） other
[Presenter]堀池徳祐、仲田昇平
[5]. indel マーカーを作成するプ ログラム LINDA（Large INDel Analyzer）の開発
園芸学会 （2023/3/20） other
[Presenter]根津巽、渡邊知輝、堀池徳祐、白澤健太、磯部祥子、島田武彦、藤井浩
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[1]. 分子進化シミュレーションによる長枝誘引の発生メカニズム解明と解消法の提案 （ 2022/4 ～ 2026/3 ） Grant-in-Aid for Scientific Research (C) leader
[2]. 重金属環境下で有害化する植物アミロイド蛋白質の凝集及び毒性発現メカニズムの解明 （ 2011/11 ～ 2016/3 ） Grant-in-Aid for Scientific Research (B) member
[3]. 系統解析用オーソログデータセット作成システムの開発 （ 2010/4 ～ 2012/3 ） Grant-in-Aid for Young Scientists (B) leader
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[1]. 無根系統樹の同型判定方法をコンピュータ上で実行可能なプログラム，それを記録したコンピュータ読取可能な記録媒体および無根系統樹の同型判定装置 [Application Number] 2005-330761 (2005/11/15)
[Notes] 公開番号：2007-140701
[2]. 相同性解析システム、相同性解析方法、相同性解析プログラム及び取引成立システム [Application Number] 2001-231810 (2001/7/31) [Patent Number] 特許第3851524号 |
[1]. 第20回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2021/2)
[Role at conference, etc.] is leader [Site of conference, etc.] オンライン開催
[2]. 第19回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2019/3)
[Role at conference, etc.] other [Site of conference, etc.] 静岡県立大学 草薙キャンパス
[3]. 第19回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2018/3)
[Role at conference, etc.] other [Site of conference, etc.] 静岡大学大学会館
[4]. 第18回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2017/3)
[Role at conference, etc.] other [Site of conference, etc.] 静岡大学大学会館
[5]. 第17回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2016/3)
[Role at conference, etc.] other [Site of conference, etc.] 静岡大学大学会館
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Education related information
[1]. General Education Course 新入生セミナー （2023(FY) - first semester )
[2]. Faculty Course ゲノムサイエンス （2023(FY) - second semester )
[3]. Faculty Course 分子生物学 （2023(FY) - first semester )
[4]. Graduate School Course(Master's) バイオインフォマティクス特論 （2023(FY) - first semester )
[5]. Graduate School Course(Master's) バイオインフォマティクス演習 （2023(FY) - first semester )
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2023(FY)
Number of undergraduate students(junior students) 3
Number of undergraduate students(senior students) 4
Number of master's course students : 3
[Notes] 2024年3月現在
2022(FY)
Number of undergraduate students(junior students) 3
Number of undergraduate students(senior students) 4
Number of master's course students : 1
Number of doctorate course students (main advisor) : 1
2021(FY)
Number of undergraduate students(junior students) 3
Number of undergraduate students(senior students) 4
Number of master's course students : 2
Number of doctorate course students (main advisor) : 1
2020(FY)
Number of undergraduate students(junior students) 3
Number of undergraduate students(senior students) 4
Number of master's course students : 2
Number of doctorate course students (main advisor) : 1
2018(FY)
Number of undergraduate students(junior students) 2
Number of undergraduate students(senior students) 5
Number of master's course students : 2 Number of doctorate course students (assistant advisor) : 1
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[1]. 静岡ライフサイエンスシンポジウム 優秀ポスター賞 (2023/6)
[Name of student who received the prize] 仲田昇平 (Graduate School of Integrated Science and Technology)
[Name of organization that offered the prize] 静岡生命科学フォーラム
[2]. 静岡ライフサイエンスシンポジウム 優秀ポスター賞 (2017/3)
[Name of student who received the prize] 下山祐紀
[Name of organization that offered the prize] 静岡生命科学若手フォーラム |
[1]. 榛原高校出張授業 （2022/7 )
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Contributions to society
[1]. symposium 農業環境教育プロジェクトワークショップ （2015/3 - 2015/3 )
[Details] 「地域住民を主役にしたネットワーキング～中山間地域の明日を拓くために」を開催
[Notes] 開催場所：もくせい会館（静岡市）
プログラム
9：30
農業環境リーダー認定式
10：20
ワークショップ「地域住民を主役にしたネットワーキング」
第1部 聞き取り調査の報告「コミュニティの課題を探る」
12：25
第2部 パネルディスカッション「地域の課題を整理する、アイディア |
[1]. newspaper 「おもしろ農学４１ 静岡大研究室から 遺伝子情報を収集 生物の進化の系譜明らかに」執筆 (2014/8/3)
[Notes] 静岡新聞朝刊７面 |
International contributions
Others