[1]. NGSロングリードから遺伝子配列を 自動フェージングするソフトウエア
第24回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2024/3/3） other
[Presenter]桐生適誠、藤井浩、堀池徳祐
[2]. 長枝誘引が発生する瞬間に何が起こるか？
第24回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2024/3/3） other
[Presenter]仲田昇平、堀池徳祐
[3]. マルチプルアラインメントデータを用いて長枝誘引の本質を探る
日本進化学会第25回大会 （2023/8/31） other
[Presenter]仲田昇平、堀池徳祐
[4]. Farris系統樹を用いて長枝誘引の本質を探る
日本進化学会第25回大会 （2023/8/31） other
[Presenter]堀池徳祐、仲田昇平
[5]. indel マーカーを作成するプ ログラム LINDA（Large INDel Analyzer）の開発
園芸学会 （2023/3/20） other
[Presenter]根津巽、渡邊知輝、堀池徳祐、白澤健太、磯部祥子、島田武彦、藤井浩
[6]. 分類情報を用いたオーソログデータセット作成プログラムOrthoPhyの開発
第17回日本ゲノム微生物学会年会 （2023/3/10） other
[Presenter]堀池徳祐、渡辺知輝
[7]. Farris系統樹で発生する長枝誘引
第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2023/3/5） other
[Presenter]仲田昇平、渡邊知輝、堀池徳祐
[8]. NGSロングリードを利用した挿入・欠失マーカー作成プログラムの開発
第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2023/3/5） other
[Presenter]根津巽、藤井浩、堀池徳祐
[9]. 食虫植物の収斂タンパク質検出と正の自然選択検定
第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2023/3/5） other
[Presenter]馬渕百恵、堀池徳祐
[10]. Farris系統樹で発生する長枝誘引
日本進化学会第24回大会 （2022/8/5） other
[Presenter]仲田昇平、渡邊知輝、堀池徳祐
[11]. マルチプルアライメント法が長枝誘引の発生に及ぼす影響の解明
日本進化学会第24回大会 （2022/8/5） other
[Presenter]渡邊知輝、堀池徳祐
[12]. 分子進化シミュレーションによる長枝誘引の系統解析への影響の調査
遺伝研研究会 生命科学を支える分子系統学 （2022/8/3） invited
[Presenter]堀池徳祐
[13]. OrthoPhy: A program for constructing an ortholog dataset using taxonomic information
Riken iTHEMS biology seminar （2022/7/28） invited
[Presenter]Tokumasa HORIIKE
[14]. The Evolution of Molybdenum Dependent Nitrogenase in Cyanobacteria
The 2nd AsiaEvo Conference （2021/8/） other
[Presenter]Tokumasa Horiike, Tomoaki Watanabe
[15]. Development of a program for constructing ortholog data set using taxonomic information
日本進化学会第23回大会 （2021/8/） other
[Presenter]Tomoaki Watanabe, Tokumasa Horiike
[16]. なぜ、どの生物からも「系統固有遺伝子」が見つかるのか？
日本進化学会第23回大会 （2021/8/） other
[Presenter]吉村 陸, 堀池 徳祐
[17]. 系統分類情報を利用したオーソログデータセット作成プログラムの開発
日本進化学会第22回大会 （2020/9/） other
[Presenter]渡邊知輝、呉耀慶、堀池徳祐
[18]. 機械学習を用いたLBA判別の試み
日本進化学会第22回大会 （2020/9/） other
[Presenter]呉耀慶、堀池徳祐
[19]. Genome Identifier: 微生物ゲノム配列用系統解析ツール
情報処理学会第61回バイオ情報学研究会 （2020/3/12） other
[Presenter]堀池徳祐、下山祐紀
[20]. 系統分類情報を用いたオーソログデータセット作成法の開発
日本遺伝学会第91回大会 （2019/9/） other
[Presenter]渡邊知輝、呉耀慶、堀池徳祐
[21]. Long Branch Attraction 発生のメカニズムの解明と 発生の有無を判定するプログラムの開発
日本遺伝学会第91回大会 （2019/9/） other
[Presenter]呉耀慶、堀池徳祐
[22]. Ortholog Finder: A tool for constructing an ortholog dataset for phylogenetic analysis
Quest for orthologs 6 （2019/7/31） other
[Presenter]Tokumasa Horiike
[23]. 系統分類情報を用いたオーソログデータセット作成法の開発
第20回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2019/3/2） other
[Presenter]呉耀慶、堀池徳祐
[24]. シアノバクテリアの多細胞性の起源解明
第20回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2019/3/2） other
[Presenter]杉山賢、堀池徳祐
[25]. シアノバクテリアにおける窒素固定能の起源解明
第20回日本進化学会 （2018/8/） other
[Presenter]渡邊知輝、堀池徳祐
[Notes] 東京大学
[26]. Long Branch Attraction 発生の有無を判定するプログラムの開発
第20回日本進化学会 （2018/8/） other
[Presenter]牧野弘和、堀池徳祐
[Notes] 東京大学
[27]. エコーロケーション能を持つイルカとコウモリにおける収斂タンパク質の検出
第20回日本進化学会 （2018/8/） other
[Presenter]下山祐紀、前原愛、堀池徳祐
[Notes] 東京大学
[28]. シアノバクテリアにおける窒素固定能の起源と進化
ラン藻ゲノム交流会2018 （2018/6/） other
[Presenter]堀池徳祐
[Notes] 東京大学
[29]. シアノバクテリアの窒素固定能の起源解明
第19回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2018/3/4） other
[Presenter]渡邊知輝、堀池徳祐
[30]. 系統樹におけるLong-Branch Attractionの発生の有無を判定するプログラムの開発
第19回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2018/3/4） other
[Presenter]牧野弘和、堀池徳祐
[31]. シアノバクテリアにおける窒素固定能の起源解明
第12回日本ゲノム微生物学会年会 （2018/3/） other
[Presenter]堀池 徳祐,渡邊 知輝
[Notes] 京都大学
[32]. シアノバクテリアにおける窒素固定能の起源
第19回日本進化学会 （2017/8/） other
[Presenter]堀池 徳祐
[Notes] 京都大学
[33]. GenomeIdentifier: ゲノム情報を用いた系統解析ツール
第11回日本ゲノム微生物学会年会 （2017/3/） other
[Presenter]堀池 徳祐
[Notes] 慶応義塾大学湘南藤沢キャンパス
[34]. 全ゲノム情報を利用した系統解析プログラム GenomeIdentifier の開発
第18回ライフサイエンスシンポジウム （2017/3/） other
[Presenter]下山 祐紀,堀池 徳祐
[Notes] 静岡大学大学会館
[35]. GenomeIdentifier: a tool for phylogenetic analysis using genomic data
Genome Evolution in Mishima （2017/3/） other
[Presenter]堀池 徳祐
[Notes] 国立遺伝学研究所
[36]. オーソログデータセット作成プログラムの改良
第18回日本進化学会 （2016/8/） other
[Presenter]堀池 徳祐
[Notes] 東京工業大学
[37]. 任意の系統の進化過程における遺伝子の 獲得・欠失数推定法の改良と応用
第17回静岡ライフサイエンスシンポジウム （2016/3/） other
[Presenter]小森 大樹,堀池 徳祐
[URL of the repository, etc.]
[Notes] 開催場所：静岡大学大学会館
主 催： 静岡生命科学若手フォーラム
[38]. ゲノムが生み出す生物の新規性について
第16回 静岡ライフサイエンスシンポジウム （2015/3/） invited
[Presenter]堀池 徳祐
[URL of the repository, etc.]
[Notes] 開催場所：静岡大学大学会館
主 催： 静岡生命科学若手フォーラム
[39]. 系統固有遺伝子の起源、自動推定法の開発
第15回 静岡ライフサイエンスシンポジウム （2014/3/） other
[Presenter]友岡 裕介,堀池 徳祐
[URL of the repository, etc.]
[Notes] 開催場所：静岡理工科大学
主 催： 静岡生命科学若手フォーラム
[40]. 系統固有遺伝子の起源、自動推定法の開発
第36回日本分子生物学会年会 （2013/12/） other
[Presenter]友岡 裕介,堀池 徳祐
[Notes] 神戸
[41]. Ortho-Gen: The ortholog dataset constructing tool for phylogenetic analysis
The International Society for Computational Biology and the African Society for Bioinformatics and Computational Biology 2013 （2013/3/） other
[Presenter]Horiike T,Miyata D,Minai R,Tateno Y
[Notes] Casablanca (Morocco)
[42]. Development of ortholog dataset for phylogenetic analysis
第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会 （2012/12/） other
[Presenter]堀池 徳祐,宮田大輔,薬袋良一,舘野義男
[Notes] 神戸
[43]. Ortho-Gen: The ortholog dataset constructing tool for phylogenetic analysis
ECCB'12 - the European Conference on Computational Biology （2012/9/） other
[Presenter]Horiike T,Miyata D,Minai R
[Notes] Basel (Swiss)
[44]. Ortho-Gen: The ortholog dataset constructing tool for phylogenetic analysis.
The 2012 Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution （2012/6/） other
[Presenter]Horiike T,Miyata D,Minai R,Tateno Y
[Notes] Dublin (Ireland)
[45]. 遺伝子水平伝播シミュレーションプログラム(HGT-Gen)の開発
第6回日本ゲノム微生物学会年会 （2012/3/） other
[Presenter]堀池徳祐,宮田大輔,薬袋良一,舘野義男
[Notes] 東京
[46]. Development of new method for making ortholog dataset.
Young Researchers Conference on Evolutionary Genomics （2011/8/） invited
[Presenter]Horiike T
[Notes] Tokyo
[47]. Development of new method for making ortholog dataset.
The 2011 Annual meeting of the society for molecular biology and evolution （2011/7/） other
[Presenter]Horiike T,Miyata D,Minai R,Tateno Y
[Notes] Kyoto
[48]. 系統解析用オーソログデータセット作成法の開発
BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会） （2010/12/） other
[Presenter]堀池徳祐,宮田大輔,薬袋良一,舘野義男
[Notes] 大阪
[49]. 系統解析用オーソログデータセット作成法の開発
第12回日本進化学会大会 （2010/8/） other
[Presenter]堀池徳祐,宮田大輔,薬袋良一,舘野義男
[Notes] 東京
[50]. Development of new method for making ortholog dataset.
The 2010 Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution （2010/7/） other
[Presenter]Horiike T,Miyata D,Minai R,Tateno Y
[Notes] Lyon (France)
[51]. Phylogenetic tree of prokaryotes with Positive Ortholog Ratio.
The 2009 Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution （2009/6/） other
[Presenter]Horiike T,Miyata D,Tateno Y
[Notes] Iowa city (USA)
[52]. 大量オーソログデータを用いた原核生物の系統樹解析
第三回日本ゲノム微生物学会 （2009/3/） other
[Presenter]堀池徳祐,宮田大輔,舘野義男
[Notes] 東京
|