[1]. NGSロングリードから遺伝子配列を自動フェージングするソフトウエア 第24回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2024年3月3日) 招待講演以外 [発表者]桐生適誠、藤井浩、堀池徳祐 [2]. 長枝誘引が発生する瞬間に何が起こるか? 第24回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2024年3月3日) 招待講演以外 [発表者]仲田昇平、堀池徳祐 [3]. マルチプルアラインメントデータを用いて長枝誘引の本質を探る 日本進化学会第25回大会 (2023年8月31日) 招待講演以外 [発表者]仲田昇平、堀池徳祐 [4]. Farris系統樹を用いて長枝誘引の本質を探る 日本進化学会第25回大会 (2023年8月31日) 招待講演以外 [発表者]堀池徳祐、仲田昇平 [5]. indel マーカーを作成するプ ログラム LINDA(Large INDel Analyzer)の開発 園芸学会 (2023年3月20日) 招待講演以外 [発表者]根津巽、渡邊知輝、堀池徳祐、白澤健太、磯部祥子、島田武彦、藤井浩 [6]. 分類情報を用いたオーソログデータセット作成プログラムOrthoPhyの開発 第17回日本ゲノム微生物学会年会 (2023年3月10日) 招待講演以外 [発表者]堀池徳祐、渡辺知輝 [7]. Farris系統樹で発生する長枝誘引 第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2023年3月5日) 招待講演以外 [発表者]仲田昇平、渡邊知輝、堀池徳祐 [8]. NGSロングリードを利用した挿入・欠失マーカー作成プログラムの開発 第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2023年3月5日) 招待講演以外 [発表者]根津巽、藤井浩、堀池徳祐 [9]. 食虫植物の収斂タンパク質検出と正の自然選択検定 第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2023年3月5日) 招待講演以外 [発表者]馬渕百恵、堀池徳祐 [10]. Farris系統樹で発生する長枝誘引 日本進化学会第24回大会 (2022年8月5日) 招待講演以外 [発表者]仲田昇平、渡邊知輝、堀池徳祐 [11]. マルチプルアライメント法が長枝誘引の発生に及ぼす影響の解明 日本進化学会第24回大会 (2022年8月5日) 招待講演以外 [発表者]渡邊知輝、堀池徳祐 [12]. 分子進化シミュレーションによる長枝誘引の系統解析への影響の調査 遺伝研研究会 生命科学を支える分子系統学 (2022年8月3日) 招待講演 [発表者]堀池徳祐 [13]. OrthoPhy: A program for constructing an ortholog dataset using taxonomic information Riken iTHEMS biology seminar (2022年7月28日) 招待講演 [発表者]Tokumasa HORIIKE [14]. The Evolution of Molybdenum Dependent Nitrogenase in Cyanobacteria The 2nd AsiaEvo Conference (2021年8月) 招待講演以外 [発表者]Tokumasa Horiike, Tomoaki Watanabe [15]. Development of a program for constructing ortholog data set using taxonomic information 日本進化学会第23回大会 (2021年8月) 招待講演以外 [発表者]Tomoaki Watanabe, Tokumasa Horiike [16]. なぜ、どの生物からも「系統固有遺伝子」が見つかるのか? 日本進化学会第23回大会 (2021年8月) 招待講演以外 [発表者]吉村 陸, 堀池 徳祐 [17]. 系統分類情報を利用したオーソログデータセット作成プログラムの開発 日本進化学会第22回大会 (2020年9月) 招待講演以外 [発表者]渡邊知輝、呉耀慶、堀池徳祐 [18]. 機械学習を用いたLBA判別の試み 日本進化学会第22回大会 (2020年9月) 招待講演以外 [発表者]呉耀慶、堀池徳祐 [19]. Genome Identifier: 微生物ゲノム配列用系統解析ツール 情報処理学会第61回バイオ情報学研究会 (2020年3月12日) 招待講演以外 [発表者]堀池徳祐、下山祐紀 [20]. 系統分類情報を用いたオーソログデータセット作成法の開発 日本遺伝学会第91回大会 (2019年9月) 招待講演以外 [発表者]渡邊知輝、呉耀慶、堀池徳祐 [21]. Long Branch Attraction 発生のメカニズムの解明と 発生の有無を判定するプログラムの開発 日本遺伝学会第91回大会 (2019年9月) 招待講演以外 [発表者]呉耀慶、堀池徳祐 [22]. Ortholog Finder: A tool for constructing an ortholog dataset for phylogenetic analysis Quest for orthologs 6 (2019年7月31日) 招待講演以外 [発表者]Tokumasa Horiike [23]. 系統分類情報を用いたオーソログデータセット作成法の開発 第20回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2019年3月2日) 招待講演以外 [発表者]呉耀慶、堀池徳祐 [24]. シアノバクテリアの多細胞性の起源解明 第20回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2019年3月2日) 招待講演以外 [発表者]杉山賢、堀池徳祐 [25]. シアノバクテリアにおける窒素固定能の起源解明 第20回日本進化学会 (2018年8月) 招待講演以外 [発表者]渡邊知輝、堀池徳祐 [備考] 東京大学 [26]. Long Branch Attraction 発生の有無を判定するプログラムの開発 第20回日本進化学会 (2018年8月) 招待講演以外 [発表者]牧野弘和、堀池徳祐 [備考] 東京大学 [27]. エコーロケーション能を持つイルカとコウモリにおける収斂タンパク質の検出 第20回日本進化学会 (2018年8月) 招待講演以外 [発表者]下山祐紀、前原愛、堀池徳祐 [備考] 東京大学 [28]. シアノバクテリアにおける窒素固定能の起源と進化 ラン藻ゲノム交流会2018 (2018年6月) 招待講演以外 [発表者]堀池徳祐 [備考] 東京大学 [29]. シアノバクテリアの窒素固定能の起源解明 第19回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2018年3月4日) 招待講演以外 [発表者]渡邊知輝、堀池徳祐 [30]. 系統樹におけるLong-Branch Attractionの発生の有無を判定するプログラムの開発 第19回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2018年3月4日) 招待講演以外 [発表者]牧野弘和、堀池徳祐 [31]. シアノバクテリアにおける窒素固定能の起源解明 第12回日本ゲノム微生物学会年会 (2018年3月) 招待講演以外 [発表者]堀池 徳祐,渡邊 知輝 [備考] 京都大学 [32]. シアノバクテリアにおける窒素固定能の起源 第19回日本進化学会 (2017年8月) 招待講演以外 [発表者]堀池 徳祐 [備考] 京都大学 [33]. GenomeIdentifier: ゲノム情報を用いた系統解析ツール 第11回日本ゲノム微生物学会年会 (2017年3月) 招待講演以外 [発表者]堀池 徳祐 [備考] 慶応義塾大学湘南藤沢キャンパス [34]. 全ゲノム情報を利用した系統解析プログラム GenomeIdentifier の開発 第18回ライフサイエンスシンポジウム (2017年3月) 招待講演以外 [発表者]下山 祐紀,堀池 徳祐 [備考] 静岡大学大学会館 [35]. GenomeIdentifier: a tool for phylogenetic analysis using genomic data Genome Evolution in Mishima (2017年3月) 招待講演以外 [発表者]堀池 徳祐 [備考] 国立遺伝学研究所 [36]. オーソログデータセット作成プログラムの改良 第18回日本進化学会 (2016年8月) 招待講演以外 [発表者]堀池 徳祐 [備考] 東京工業大学 [37]. 任意の系統の進化過程における遺伝子の獲得・欠失数推定法の改良と応用 第17回静岡ライフサイエンスシンポジウム (2016年3月) 招待講演以外 [発表者]小森 大樹,堀池 徳祐 [URL] [備考] 開催場所:静岡大学大学会館
主 催: 静岡生命科学若手フォーラム [38]. ゲノムが生み出す生物の新規性について 第16回 静岡ライフサイエンスシンポジウム (2015年3月) 招待講演 [発表者]堀池 徳祐 [URL] [備考] 開催場所:静岡大学大学会館
主 催: 静岡生命科学若手フォーラム [39]. 系統固有遺伝子の起源、自動推定法の開発 第15回 静岡ライフサイエンスシンポジウム (2014年3月) 招待講演以外 [発表者]友岡 裕介,堀池 徳祐 [URL] [備考] 開催場所:静岡理工科大学
主 催: 静岡生命科学若手フォーラム [40]. 系統固有遺伝子の起源、自動推定法の開発 第36回日本分子生物学会年会 (2013年12月) 招待講演以外 [発表者]友岡 裕介,堀池 徳祐 [備考] 神戸 [41]. Ortho-Gen: The ortholog dataset constructing tool for phylogenetic analysis The International Society for Computational Biology and the African Society for Bioinformatics and Computational Biology 2013 (2013年3月) 招待講演以外 [発表者]Horiike T,Miyata D,Minai R,Tateno Y [備考] Casablanca (Morocco) [42]. Development of ortholog dataset for phylogenetic analysis 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会 (2012年12月) 招待講演以外 [発表者]堀池 徳祐,宮田大輔,薬袋良一,舘野義男 [備考] 神戸 [43]. Ortho-Gen: The ortholog dataset constructing tool for phylogenetic analysis ECCB'12 - the European Conference on Computational Biology (2012年9月) 招待講演以外 [発表者]Horiike T,Miyata D,Minai R [備考] Basel (Swiss) [44]. Ortho-Gen: The ortholog dataset constructing tool for phylogenetic analysis. The 2012 Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution (2012年6月) 招待講演以外 [発表者]Horiike T,Miyata D,Minai R,Tateno Y [備考] Dublin (Ireland) [45]. 遺伝子水平伝播シミュレーションプログラム(HGT-Gen)の開発 第6回日本ゲノム微生物学会年会 (2012年3月) 招待講演以外 [発表者]堀池徳祐,宮田大輔,薬袋良一,舘野義男 [備考] 東京 [46]. Development of new method for making ortholog dataset. Young Researchers Conference on Evolutionary Genomics (2011年8月) 招待講演 [発表者]Horiike T [備考] Tokyo [47]. Development of new method for making ortholog dataset. The 2011 Annual meeting of the society for molecular biology and evolution (2011年7月) 招待講演以外 [発表者]Horiike T,Miyata D,Minai R,Tateno Y [備考] Kyoto [48]. 系統解析用オーソログデータセット作成法の開発 BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会) (2010年12月) 招待講演以外 [発表者]堀池徳祐,宮田大輔,薬袋良一,舘野義男 [備考] 大阪 [49]. 系統解析用オーソログデータセット作成法の開発 第12回日本進化学会大会 (2010年8月) 招待講演以外 [発表者]堀池徳祐,宮田大輔,薬袋良一,舘野義男 [備考] 東京 [50]. Development of new method for making ortholog dataset. The 2010 Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution (2010年7月) 招待講演以外 [発表者]Horiike T,Miyata D,Minai R,Tateno Y [備考] Lyon (France) [51]. Phylogenetic tree of prokaryotes with Positive Ortholog Ratio. The 2009 Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution (2009年6月) 招待講演以外 [発表者]Horiike T,Miyata D,Tateno Y [備考] Iowa city (USA) [52]. 大量オーソログデータを用いた原核生物の系統樹解析 第三回日本ゲノム微生物学会 (2009年3月) 招待講演以外 [発表者]堀池徳祐,宮田大輔,舘野義男 [備考] 東京
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