[1]. Theoretical analysis toward better description of the wavenumber shifts of the OH stretch of hydrogen-bonded water
Journal of Raman Spectroscopy / - （2022年） [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[著者] Yukichi Kitamura, Hajime Torii [備考] 計算の実行、解析、考察
[DOI]
[2]. Theoretical Prediction of pH-dependent Electronic Spectra in Aqueous Solution: A Combinational Application of QM/MM Calculations and Constant-pH Simulations with Configuration-Selection Scheme
Chemical Physics Letters 798/ 139624- （2022年） [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[著者] Carlos Bistafa, Yukichi Kitamura, Masataka Nagaoka [備考] プログラム作成、考察
[DOI]
[3]. ヘモグロビンのアロステリック制御に関するデータ科学的研究 ‒四次構造変化に対する塩素イオンの役割‒
Journal of Computer Chemistry, Japan 20/3 97-99 （2021年） [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[著者] M. Tanaka, Y. Takahashi, K. Takami, Y. Kitamura, M. Nagaoka [備考] 研究計画、プログラム作成、議論
[DOI]
[4]. Chloride Ions Stabilize Human Adult Hemoglobin in T-State, Competing with Allosteric Interaction of Oxygen Molecules
The Journal of Physical Chemistry B 125/46 12670-12677 （2021年） [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[著者] Ikuo Kurisaki, Yume Takahashi, Yukichi Kitamura, and Masataka Nagaoka [備考] プログラム作成、議論
[DOI]
[5]. Performance Research of Clustering Methods for Detecting State Transition Trajectories in Hemoglobin
Journal of Computer Chemistry, Japan 19/4 154-157 （2021年） [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[著者] Kei TAKAMI, Yukichi KITAMURA, Masataka NAGAOKA [備考] プログラミング、結果の議論・考察
[DOI]
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[1]. Molecular Technology, Volume 3: Materials Innovation, Eds. H. Yamamoto and T. Kato
Wiley-VCH （2019年）
[著書の別]著書（研究）
[単著・共著・編著等の別] 分担執筆
[著者]M. Nagaoka, M. Takayanagi, N. Takenaka, Y. Suzuki, K. Matsumoto, N. Koga, K. S. Sandhya, U. Purushotham, Y. Kitamura [担当範囲] Computational Molecular Technology Toward Macroscopic Chemical Phenomena: Red Moon Methodology and Its Related Applications [総頁数] 351 [担当頁] pp. 201–234
[2]. Quantum Modeling of Complex Molecular Systems (Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics), Eds. J.-L. Rivail. Manuel F. Ruiz-López and X. Assfeld
Springer （2015年）
[著書の別]著書（研究）
[単著・共著・編著等の別] 分担執筆
[著者]Yukichi Kitamura, Norio Takenaka, Yoshiyuki Koyano, Masataka Nagaoka [担当範囲] Free Energy Gradient Method and its Recent Related Developments: Free Energy Optimization and Vibrational Frequency Analysis in Solution [総頁数] 523 [担当頁] pp. 219–252
[3]. Practical Aspects of Computational Chemistry III, Eds. M. Shukla and J. Leszczynski
Springer （2014年）
[著書の別]著書（研究）
[単著・共著・編著等の別] 分担執筆
[著者]Herbert C. Georg, Tamires S. Fernandes, Sylvio Canuto, Norio Takenaka, Yukichi Kitamura, Masataka Nagaoka [担当範囲] A Combination of the Sequential QM/MM and the Free Energy Gradient Methodologies with Applications [総頁数] 436 [担当頁] pp. 231–247
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[1]. 伸縮振動モードの振動数予測モデルにおける記述子の解析
凝集系の理論化学研究会 （2023年3月10日） 招待講演
[発表者]北村 勇吉
[備考] 開催場所：沖縄県市町村自治会館
主催団体：研究会「凝集系の理論化学」
[2]. Theoretical analysis toward better description of the frequency shifts of the OH stretch of hydrogen-bonded water
Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists (APCTCC-10) （2023年2月20日） 招待講演以外
[発表者]Yukichi KITAMURA, Hajime TORII
[備考] 開催場所：ベトナム（クイニョン）
主催団体：Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists
[3]. Histidine Protonation State Regulates the Structural Stability of R state Hemoglobin
Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists (APCTCC-10) （2023年2月19日） 招待講演以外
[発表者]Haruka Yotsuya, Miho Tanaka, Yukichi Kitamura, Masataka Nagaoka
[備考] 開催場所：ベトナム（クイニョン） 主催団体：Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists
[4]. GPU版配置選択pH(CS-CpH)法の開発とその応用
第36回分子シミュレーション討論会 （2022年12月5日） 招待講演以外
[発表者]稲垣風花、北村勇吉、四谷悠、長岡正隆
[備考] 開催場所：東京工業大学、主催団体：分子シミュレーション学会
[5]. Theoretical analysis toward better description of the frequency shifts of the OH stretch of hydrogen-bonded water
第45回ケモインフォマティクス討論会 （2022年11月18日） 招待講演以外
[発表者]北村勇吉，鳥居肇
[備考] 開催場所：九州大学 筑紫キャンパス 筑紫ホール
主催：日本化学会 ケモインフォマティクス部会
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[1]. その他 【学術・技術指導】計算化学基盤技術（量子化学計算・分子動力学シミュレーション）の指導
代表 （ 2022年11月 ～ 2023年4月 )
[相手先] 株式会社アイセロ |
[1]. pHや共溶質濃度の変化による蛋白質機能調節の機構解明:計算化学とデータ科学の融合 （ 2022年4月 ～ 2025年3月 ） 基盤研究(B) 分担
[2]. pH依存環境の計算化学とデータ科学の融合－分子凝集から生体分子機能まで－ （ 2021年10月 ～ 2022年3月 ） 基盤研究(B) 分担
[3]. pH依存活性錯合体の計算化学-ミクロ定pH法の開発から遷移状態制御へ- （ 2016年7月 ～ 2019年3月 ） 基盤研究(B) 分担
[4]. 溶液反応におけるｐＨ依存特性の計算化学的解明－溶媒和構造と吸収スペクトル変化－ （ 2013年4月 ～ 2015年3月 ） 特別研究員奨励費 代表
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[1]. エクセレントドクター賞 グリシン水溶液における微視的溶媒効果に関する理論的研究 （2015年3月)
[授与機関] 名古屋大学大学大学院情報学研究科
[2]. 日本学術振興会特別研究員 (DC2) 溶液反応におけるｐＨ依存特性の計算化学的解明－溶媒和構造と吸収スペクトル変化－ （2013年4月)
[授与機関] 日本学術振興会 |
[1]. 「富岳」試行課題（一般／産業）採択（2022年4月～2023年7月） （2022年4月 - 2023年7月 )
[備考] 課題名「ヒト成人ヘモグロビン分子動力学シミュレーションにおける並列計算効率の検討」
副代表として参画
[2]. 次世代二次電池・燃料電池開発によるET革命に向けた計算・データ材料科学研究 （2020年4月 - 2023年3月 )
[備考] サブ課題A-1：電解液系次世代二次電池（革新型液系二次電池）に協力者（計算・データ科学研究）として参加している。 |